Yazar "Töreyin, Behçet Uğur" için listeleme
-
Automated scoring of CerbB2/HER2 receptors using histogram based analysis of immunohistochemistry breast cancer tissue images
Kabakçı, Kaan Aykut; Çakır, Aslı; Türkmen, İlknur; Töreyin, Behçet Uğur; Çapar, Abdulkerim (Elsevier Ltd, 2021)Background and Objective: Visual expression of invasive breast cancer with immunohistochemistry (IHC) allows evaluation of CerbB2 receptors, such that CerbB2 mutated breast carcinomas are suitable for targeted therapy. ... -
Classification of cervical precursor lesions via local histogram and cell morphometric features
Çalık, Nurullah; Albayrak, Abdulkadir; Akhan, Aslı; Türkmen, İlknur; Çapar, Abdülkerim; Töreyin, Behçet Uğur; Bilgin, Gökhan; Müezzinoğlu, Bahar; Durak Ata, Lütfiye (IEEE-Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2023)Cervical squamous intra-epithelial lesions (SIL) are precursor cancer lesions and their diagnosis is important because patients have a chance to be cured before cancer develops. In the diagnosis of the disease, pathologists ... -
DeepMQ: A deep learning approach based myelin quantification in microscopic fluorescence images
Çimen, Sibel; Çapar, Abdülkerim; Ekinci, Dursun Ali; Ayten, Umut Engin; Kerman, Bilal Ersen; Töreyin, Behçet Uğur (IEEE Computer Society, 2018)Oligodendrocytes wrap around the axons and form the myelin. Myelin facilitates rapid neural signal transmission. Any damage to myelin disrupts neuronal communication leading to neurological diseases such as multiple sclerosis ... -
Floresan mikroskop görüntülerinde miyelin segmentasyonu
Yetiş, Sibel Çimen; Ekinci, Dursun Ali; Çakır, Ertan; Ekşioglu, Ender Mete; Ayten, Umut Engin; Çapar, Abdülkerim; Töreyin, Behçet Uğur; Kerman, Bilal Ersen (Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2019)Aksonların etrafına sarılmış¸ miyelin kılıf, hızlı bir şekilde sinyal iletimini sağlar ve deformasyonu, Multipl Skleroz (MS) gibi çeşitli nörodejeneratif hastalıklara neden olur. Aday ilaç geliştirilmesi için, miyelinizasyonun ... -
Meme kanserinde CerbB2 tümör hücrelerinin sınıflandırılması için derin öğrenme tabanlı bir yaklaşım
Tataroğlu, Gözde Ayşe; Genç, Anıl; Kabakçı, Kaan A.; Çapar, Abdülkerim; Töreyin, Behçet Uğur; Ekenel, Hazim Kemal; Çetinaslan Türkmen, İlknur; Erdoğan Çakır, Aslı (Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., 2017)Bu çalışmada, meme kanserinde CerbB2 tümör hücre skorlarının derin öğrenme modellerine dayalı olarak sınıflandırılmasına yönelik, özgün bir yaklaşım önerilmektedir. Bildirinin bir diğer katkısı da, özgün meme kanseri ... -
Mikroskobik floresan in situ hibridizasyon (FISH) görüntülerde çoklu seviye eşikleme tabanlı bölütleme yöntemi
Kabakçı, Kaan; Çapar, Abdulkerim; Töreyin, Behçet Uğur; Akkoç, Mertkan; Borazan, Ozan; Türkmen, İlknur; Durak Ata, Lütfiye (Institute of Engineers and Everyone Else, 2016)Kanser tanısında yaygın olarak kullanılan Floresan In Situ Hibridizasyon (FISH) tekniği, kromozom bölgelerinin özel boyalarla boyanarak FISH sinyalleri hâlinde görüntülenmesine dayanır. Bu çalışmada, FISH tekniğiyle elde ... -
A multi-spectral myelin annotation tool for machine learning based myelin quantification [version 1; peer review: 1 not approved]
Çapar, Abdulkerim; Çimen Yetiş, Sibel; Aladağ, Zeynep; Ekinci, Dursun Ali; Ayten, Umut Engin; Kerman, Bilal Ersen; Töreyin, Behçet Uğur (F1000 Research Ltd, 2021)Myelin is an essential component of the nervous system and myelin damage causes demyelination diseases. Myelin is a sheet of oligodendrocyte membrane wrapped around the neuronal axon. In the fluorescent images, experts ... -
Myelin detection in fluorescence microscopy images using machine learning
Çimen Yetiş, Sibel; Çapar, Abdulkerim; Ekinci, Dursun Ali; Ayten, Umut Engin; Kerman, Bilal Ersan; Töreyin, Behçet Uğur (Elsevier, 2020)Background: The myelin sheath produced by glial cells insulates the axons, and supports the function of the nervous system. Myelin sheath degeneration causes neurodegenerative disorders, such as multiple sclerosis (MS). ... -
Rahim ağzı (serviks) kanserinde öncü lezyonların evrişimsel sinir aglarıyla bölütlenmesi
Albayrak, Abdulkadir; Ünlü, Aslı; Çalık, Nurullah; Bilgin, Gökhan; Türkmen, İlknur; Çakır, Aslı; Çapar, Abdulkerim; Töreyin, Behçet Uğur; Durak Ata, Lütfiye (IEEE, 2017)Ülkemizde ve dünyada en sık görülen kanser tiplerinden olan rahim ağzı (serviks) kanseri, kanser öncüsü lezyonlarından gelişmektedir. Kanser öncüsü bu lezyonların saptanması, hastanın kanser olmadan tedavi olmasına olanak ... -
A whole-slide image grading benchmark and tissue classification for cervical cancer precursor lesions with inter-observer variability
Albayrak, Abdulkadir; Ünlü Akhan, Aslı; Çalık, Nurullah; Çapar, Abdulkerim; Bilgin, Gökhan; Töreyin, Behçet Uğur; Müezzinoğlu, Bahar; Türkmen, İlknur; Durak Ata, Lütfiye (Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, 2021)he cervical cancer developing from the precancerous lesions caused by the human papillomavirus (HPV) has been one of the preventable cancers with the help of periodic screening. Cervical intraepithelial neoplasia (CIN) and ...